我住三楼，因为排污总管堵塞反水，不得已将自己家的口子封堵。物业说我们不配合疏通，认为我们违法，要告

违法，简单的讲就是违反法律规定，你闯红灯也是违法，只要不触及刑法别太恐惧。

这件事，你有可能侵权了，侵权会涉及民事纠纷跟赔偿。

排污管，涉及的是相邻权，你的不配合侵犯其它共用管道的业主的权益，可能会法院会判你回复原状、配合维修以及损失赔偿，当然堵塞跟封堵的情况你描述不全面，无法判定你需要承担的责任的份额。

因为我是三楼，由于二楼封堵了，所以物业想从我家进行疏通，我认为应该找楼下配合，物业目前因为说服不了二楼，所以对我三楼提要求

我澄清一点，我未封堵主管路，仅是将到我家里的支管出口处进行了封堵

物业查明封堵点没有，如果是在你家跟2楼之间出现的堵点，建议你配合好点，你可以跟物业要点额外的补偿。
邻里之间还是和谐点好，物业没法疏通，顶多你们这个楼栋管道都不能使用，多听点抱怨而已，生活困顿的还是你们自己。
估计物业也就是吓唬吓唬你，真的起诉你，民事诉讼还是很耗时间的，3-6个月的周期。